Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms