Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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