Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MCOLN3Q8TDD5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MCOLN3Q8TDD5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms