Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms