Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC33Q8N5R6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms