Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS3Q8IXF0 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms