Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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