Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms