Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms