Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWISTNBQ3B726 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms