Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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