Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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