Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF827Q17R98 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF827Q17R98 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms