Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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