Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms