Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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