Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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