Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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RAB40BQ12829 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB40BQ12829 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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