Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms