Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TYRO3Q06418 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TYRO3Q06418 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms