Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APBA1Q02410 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms