Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MC1RQ01726 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms