Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HERV-K104P63124 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HERV-K104P63124 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERV-K104P63124 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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