Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BRCA2P51587 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms