Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NESP48681 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NESP48681 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NESP48681 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NESP48681 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NESP48681 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NESP48681 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms