Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANGAP1P46060 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms