Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms