Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPOP42166 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMPOP42166 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMPOP42166 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms