Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms