Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms