Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBP1P32455 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP1P32455 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms