Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms