Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms