Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPRDP23468 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRDP23468 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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