Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms