Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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