Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms