Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms