Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TULP3O75386 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms