Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RNF40O75150 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF40O75150 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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