Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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