Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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