Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms