Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms