Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms