Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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