Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms