Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms