Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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