Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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